堿性條件下聚丙烯酰胺凝膠易聚合，而酸性條件下由于缺少TEMED的游離堿，難以聚合。

在瓊脂糖凝膠電泳中，DNA分子帶負(fù)電荷，來(lái)源于其磷酸骨架。因電荷密度均一，DNA分子所帶電荷與分子量成正比。

在雙向電泳系統(tǒng)中無(wú)需濃縮膠，因?yàn)榈谝幌虻入娋劢挂呀?jīng)使得蛋白得到濃縮。

泡沫分離過(guò)程中，高速攪拌表面活性劑溶液制備的泡沫尺寸更小、穩(wěn)定性更強(qiáng)，分離效果更好。

雙向電泳就是第一向采用等電聚焦分離，第二向?yàn)镾DS-PAGE分離。