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分子軌道（MO）是分子中的單電子空間波函數(shù)，可以用原子軌道的線性組合來表示，MO并不表明了電子運(yùn)動(dòng)的確切軌跡。分子的Schrödinger方程可以利用變分法近似求解，由此得到的能量總是等于或低于分子真實(shí)的基態(tài)能量。求解方程時(shí)通常使用定核近似，因?yàn)榉肿拥暮斯羌軐?shí)際上固定不變的。分子中電子數(shù)如果是偶數(shù)，分子就必然是反磁性的，例如O₂分子就是如此。根據(jù)電子在MO上的排布可以計(jì)算鍵級(jí)，鍵級(jí)都是一些整數(shù)。