等電聚焦電泳對蛋白質的分離僅僅取決于蛋白質的等電點，因此可以在凝膠的任何位置加樣。

超濾過程中，膜兩側滲透壓差較小，操作壓力比反滲透操作低，一般為0.1～1.0MPa。

合成高分子材料中的聚砜主要用于制造反滲透膜，而聚酰胺膜常用于制造超濾膜。

中空纖維膜組件的內徑較大，結構簡單，適合于處理懸浮物含量較高的料液，分離操作完成后的清洗比較容易。

在雙向電泳系統(tǒng)中無需濃縮膠，因為第一向等電聚焦已經使得蛋白得到濃縮。