雙向電泳就是第一向采用等電聚焦分離，第二向為SDS-PAGE分離。

堿性條件下聚丙烯酰胺凝膠易聚合，而酸性條件下由于缺少TEMED的游離堿，難以聚合。

在雙向電泳系統(tǒng)中無需濃縮膠，因為第一向等電聚焦已經(jīng)使得蛋白得到濃縮。

反滲透操作過程中所施加的壓力必須大于滲透壓，一般壓力常達(dá)到1~10MPa。

等電聚焦電泳按照形成pH梯度方式可分為載體兩性電解質(zhì)等電聚焦電泳和固相pH梯度等電聚焦電泳。