ABC會計師事務所的A注冊會計師負責對甲公司20×8年度財務報表進行審計。 
20×9年2月15日，A注冊會計師完成審計業(yè)務，并于5月15日將審計工作底稿歸整為最終審計檔案。20×9年5月20日，A注冊會計師意識到甲公司存在舞弊行為，私下修改了部分審計工作底稿。20×9年6月1日，甲公司財務舞弊案爆發(fā)，A注冊會計師擅自銷毀了甲公司審計工作底稿。 
要求： 
根據審計工作底稿準則和會計師事務所質量控制準則，回答下列問題： 
(1)A注冊會計師在歸整審計檔案時是否存在問題，并簡要說明理由。 
(2)在歸整審計檔案后，A注冊會計師私下修改審計工作底稿是否存在問題，并簡要說明理由。 
(3)ABC會計師事務所在保存審計工作底稿方面是否存在問題，簡要說明理由，并簡要說明ABC會計師事務所應當對審計工作底稿實施哪些控制程序。

A注冊會計師負責審計甲公司20×8年度財務報表。在了解甲公司內部控制后，A注冊會計師決定采用審計抽樣的方法對擬信賴的內部控制進行測試，部分做法摘錄如下：
(1)為測試20X8年度信用審核控制是否有效運行，將20X8年1月1日至ll月30日期間的所有銷售單界定為測試總體。
(2)為測試20X8年度采購付款憑證審批控制是否有效運行，將采購憑證缺乏審批人員簽字或雖有簽字但未按制度審批的界定為控制偏差。
(3)在使用隨機數表選取樣本項目時，由于所選中的1張憑證已經丟失，無法測試，直接用隨機數表另選1張憑證代替。
(4)在對存貨驗收控制進行測試時，確定樣本規(guī)模為60，測試后發(fā)現(xiàn)3例偏差。在此情況下，推斷20×8年度該項控制偏差率的最佳估計為5％。
(5)在上述第(4)項的基礎上，A注冊會計師確定的信賴過度風險為5％，可容忍偏差率為7％。由于存貨驗收控制的偏差率的最佳估計不超過可容忍偏差率，認定該項控制運行有效(注：信賴過度風險為5％時，樣本中發(fā)現(xiàn)偏差數“3”對應的控制測試風險系數為7.8)。
要求：
針對上述第(1)項至第(5)項，逐項指出A注冊會計師的做法是否正確。如不正確，簡要說明理由。