組織實(shí)施具有控制性的和跨區(qū)域跨流域的重要水利工程建設(shè)與運(yùn)行管理。組織提出并協(xié)調(diào)落實(shí)（）和的有關(guān)政策措施，指導(dǎo)監(jiān)督工程安全運(yùn)行，組織工程驗(yàn)收有關(guān)工作，督促指導(dǎo)地方配套工程建設(shè)。

水文司

組織編制重要（）和重要（）的防御洪水抗御旱災(zāi)調(diào)度及應(yīng)急水量調(diào)度方案，按程序報(bào)批并組織實(shí)施。承擔(dān)防御洪水應(yīng)急搶險(xiǎn)的技術(shù)支撐工作。承擔(dān)臺風(fēng)防御期間重要水工程調(diào)度工作。

三峽工程管理司

水庫移民司

擬訂節(jié)約用水政策，組織編制節(jié)約用水規(guī)劃并監(jiān)督實(shí)施，組織制定有關(guān)標(biāo)準(zhǔn)。組織實(shí)施（），指導(dǎo)和推動節(jié)水型社會建設(shè)工作。

起草水利法律法規(guī)草案和（），研究擬訂水利工作的政策并監(jiān)督實(shí)施。指導(dǎo)水利行政許可工作并（）。

農(nóng)村水利水電司

國際合作與科技司

編制部門預(yù)算并組織實(shí)施，承擔(dān)財(cái)務(wù)管理和資產(chǎn)管理工作。組織提出中央水利財(cái)政資金安排建議，并統(tǒng)籌協(xié)調(diào)項(xiàng)目實(shí)施的監(jiān)督管理和績效評價(jià)。提出有關(guān)（）、信貸的建議。